Sesi kualifikasi seri Aragon kembali dikuasai oleh Casey Stoner sama dengan tahun 2010 lalu. Stoner yang sudah tampak kuat sejak sesi latihan bebas, kembali membuktikan diri akan ketangguhannya di sirkuit ini. Meski Aragon terletak di Spanyol namun pembalap tuan rumah tidak berhasil menjadi yang tercepat. Pembalap tuan rumah, Dani Pedrosa besok akan start dari posisi kedua dan diikuti oleh pembalap Yamaha Factory Racing, Ben Spies melengkapi front row.
Dengan perolehan waktu 1’48.451, Stoner berhasil meraih pole position sekaligus menajampkan rekor fastest lap atas nama dirinya sendiri 1’48.942 yang ditorehkannya tahun lalu. Dari semua pembalap, hanya Stoner dan Pedrosa yang mampu melebihi rekor stoner tersebut sedangkan yang lain tidak mampu lebih cepat dari 1’49 detik.

Sementara itu sang juara bertahan, Jorge Lorenzo yang tampil di negaranya sendiri tidak bisa tampil maksimal sehingga di sesi kualifikasi ini harus puas menduduki posisi 4 dan kembali start dari baris kedua. Dibelakang Lorenzo ada pembalap Repsol Honda lainnya, Andrea Dovizioso melengkapi posisi 5 besar. Prestasi cukup baik diraih oleh Nicky Hayden dengan menempati posisi start ke 7 sekaligus menjadi pembalap tercepat dengan motor Ducati, sedangkan rekan satu timnya, Valentino Rossi besok harus mengawali race dari grid ke 13.
Hasil sesi kualifikasi selengkapnya adalah sebagai berikut: 1    Casey STONER        Repsol Honda Team        1’48.451
2    Dani PEDROSA        Repsol Honda Team        1’48.747    0.296
3    Ben SPIES        Yamaha Factory Racing        1’49.155    0.704
4    Jorge LORENZO        Yamaha Factory Racing        1’49.270    0.819
5    Andrea DOVIZIOSO    ITA    Repsol Honda Team    1’49.372    0.921
6    Marco SIMONCELLI    ITA    San Carlo Honda Gresini    1’49.528    1.077
7    Nicky HAYDEN        Ducati Team            1’49.752    1.301
8    Karel ABRAHAM        Cardion AB Motoracing        1’49.777    1.326
9    Hiroshi AOYAMA        San Carlo Honda Gresini        1’49.813    1.362
10    Randy DE PUNIET        Pramac Racing Team        1’49.826    1.375
11    Alvaro BAUTISTA        Rizla Suzuki MotoGP        1’49.883    1.432
12    Cal CRUTCHLOW        Monster Yamaha Tech 3        1’49.893    1.442
13    Valentino ROSSI        Ducati Team            1’49.960    1.509
14    Hector BARBERA        Mapfre Aspar Team MotoGP    1’49.976    1.525
15    Colin EDWARDS        Monster Yamaha Tech 3        1’50.105    1.654
16    Loris CAPIROSSI        Pramac Racing Team        1’50.752    2.301
17    Toni ELIAS        LCR Honda MotoGP        1’51.073    2.622